| Concelho | Variação de casos por 100 mil habitantes |
| Cuba | 5876 |
| Aguiar da Beira | 5847 |
| Figueira de Castelo Rodrigo | 5355 |
| Fornos de Algodres | 3997 |
| Alter do Chão | 3760 |
| Penalva do Castelo | 3528 |
| Borba | 3414 |
| Góis | 3286 |
| Ferreira do Zêzere | 3179 |
| Pampilhosa da Serra | 2997 |
| Alcácer do Sal | 2984 |
| Sernancelhe | 2854 |
| Vouzela | 2796 |
| Mêda | 2682 |
| Mogadouro | 2442 |
| Vila Nova de Poiares | 2407 |
| Moimenta da Beira | 2332 |
| Vila Nova de Paiva | 2219 |
| Tábua | 2147 |
| Penacova | 2132 |
| Sátão | 2116 |
| Trancoso | 2073 |
| Oliveira de Frades | 2053 |
| Caminha | 1965 |
| Arronches | 1950 |
| São João da Pesqueira | 1922 |
| Arcos de Valdevez | 1893 |
| Reguengos de Monsaraz | 1867 |
| Estremoz | 1862 |
| Tavira | 1826 |
| Setúbal | 1820 |
| Tondela | 1795 |
| Tomar | 1794 |
| Campo Maior | 1790 |
| Tarouca | 1743 |
| Boticas | 1741 |
| Paredes de Coura | 1734 |
| Nelas | 1726 |
| Sever do Vouga | 1721 |
| Monforte | 1714 |
| Vila Viçosa | 1711 |
| Melgaço | 1705 |
| Murtosa | 1693 |
| Pedrógão Grande | 1671 |
| Vila Nova de Cerveira | 1661 |
| Arraiolos | 1645 |
| Pinhel | 1645 |
| Penedono | 1621 |
| Vila Nova de Foz Côa | 1600 |
| Almeirim | 1588 |
| São Pedro do Sul | 1558 |
| Almodôvar | 1547 |
| Castro Daire | 1541 |
| Alvito | 1534 |
| Barrancos | 1530 |
| Ponte de Sor | 1520 |
| Ourém | 1512 |
| Ansião | 1478 |
| Moura | 1443 |
| Palmela | 1388 |
| Miranda do Douro | 1376 |
| Pombal | 1368 |
| Ourique | 1367 |
| Benavente | 1324 |
| Mealhada | 1321 |
| Murça | 1318 |
| Ribeira Grande | 1308 |
| Mafra | 1307 |
| Alcanena | 1288 |
| Torres Vedras | 1288 |
| Arganil | 1262 |
| Ponte de Lima | 1261 |
| Montemor-o-Novo | 1259 |
| Beja | 1254 |
| Celorico de Basto | 1239 |
| Ferreira do Alentejo | 1211 |
| Alandroal | 1182 |
| Albufeira | 1173 |
| Ponte da Barca | 1172 |
| Ribeira de Pena | 1164 |
| Viseu | 1163 |
| Loulé | 1159 |
| Vieira do Minho | 1156 |
| Arruda dos Vinhos | 1155 |
| Carregal do Sal | 1154 |
| Fundão | 1148 |
| Vila Franca de Xira | 1143 |
| Estarreja | 1130 |
| Celorico da Beira | 1126 |
| Odivelas | 1123 |
| Torres Novas | 1122 |
| Alcobaça | 1121 |
| Castro Marim | 1106 |
| Redondo | 1102 |
| Entroncamento | 1094 |
| Vale de Cambra | 1083 |
| Alfândega da Fé | 1077 |
| Ovar | 1067 |
| Coimbra | 1060 |
| Sintra | 1060 |
| Águeda | 1057 |
| Almeida | 1046 |
| Porto Santo | 1019 |
| Salvaterra de Magos | 1014 |
| Elvas | 1013 |
| Loures | 999 |
| Sertã | 995 |
| Alvaiázere | 985 |
| Rio Maior | 972 |
| Santarém | 968 |
| Póvoa de Lanhoso | 967 |
| Valença | 963 |
| Lisboa | 962 |
| Portel | 961 |
| Miranda do Corvo | 960 |
| Castelo de Vide | 959 |
| Vila Flor | 943 |
| Amadora | 942 |
| Fronteira | 941 |
| Peniche | 925 |
| Santa Maria da Feira | 924 |
| Santo Tirso | 918 |
| Nazaré | 897 |
| Vinhais | 891 |
| Lamego | 883 |
| Santa Comba Dão | 880 |
| Mação | 878 |
| Belmonte | 875 |
| Cantanhede | 874 |
| Vila Verde | 870 |
| Esposende | 869 |
| Arouca | 868 |
| Almada | 863 |
| Viana do Castelo | 861 |
| Batalha | 852 |
| Moita | 852 |
| Faro | 844 |
| Aljustrel | 837 |
| Oliveira do Bairro | 837 |
| Viana do Alentejo | 836 |
| Cabeceiras de Basto | 832 |
| Santa Marta de Penaguião | 819 |
| Sobral de Monte Agraço | 808 |
| São João da Madeira | 802 |
| Seia | 796 |
| Vila Real de Santo António | 795 |
| Anadia | 781 |
| Cascais | 773 |
| Constância | 769 |
| Guimarães | 765 |
| Chamusca | 761 |
| Mirandela | 759 |
| Oeiras | 758 |
| Aveiro | 757 |
| Vila Nova de Famalicão | 757 |
| Peso da Régua | 755 |
| Porto de Mós | 748 |
| Armamar | 746 |
| Castelo Branco | 742 |
| Vendas Novas | 738 |
| Vila do Conde | 721 |
| Olhão | 712 |
| Coruche | 709 |
| Câmara de Lobos | 707 |
| Póvoa de Varzim | 706 |
| Fafe | 701 |
| Seixal | 701 |
| Covilhã | 693 |
| Nisa | 693 |
| Lousã | 687 |
| Figueiró dos Vinhos | 682 |
| Guarda | 677 |
| Terras de Bouro | 676 |
| Marinha Grande | 672 |
| Oliveira de Azeméis | 669 |
| Albergaria-a-Velha | 667 |
| Óbidos | 667 |
| Barreiro | 661 |
| Abrantes | 660 |
| Alijó | 649 |
| Amares | 640 |
| Baião | 640 |
| Condeixa-a-Nova | 638 |
| Gouveia | 638 |
| Barcelos | 636 |
| Mondim de Basto | 634 |
| Felgueiras | 633 |
| Sesimbra | 632 |
| Gondomar | 620 |
| Azambuja | 617 |
| Leiria | 614 |
| Bragança | 604 |
| Alcoutim | 602 |
| Mangualde | 599 |
| Sines | 598 |
| Montijo | 592 |
| Vizela | 582 |
| Braga | 562 |
| Lagos | 556 |
| Cinfães | 554 |
| Vila Nova da Barquinha | 549 |
| Sabugal | 548 |
| Ílhavo | 545 |
| Valongo | 531 |
| Alenquer | 529 |
| Bombarral | 526 |
| Figueira da Foz | 520 |
| Grândola | 499 |
| Alpiarça | 496 |
| Penafiel | 495 |
| Cartaxo | 478 |
| Amarante | 476 |
| Lagoa | 475 |
| Castelo de Paiva | 473 |
| Sabrosa | 456 |
| Golegã | 449 |
| Porto | 448 |
| Monção | 447 |
| Soure | 444 |
| Chaves | 439 |
| Espinho | 437 |
| Matosinhos | 436 |
| Lourinhã | 425 |
| Mira | 422 |
| Silves | 414 |
| Alcochete | 410 |
| Cadaval | 409 |
| Mértola | 407 |
| Paredes | 405 |
| Montemor-o-Velho | 397 |
| Vagos | 396 |
| Serpa | 391 |
| Penela | 389 |
| Lousada | 378 |
| Caldas da Rainha | 373 |
| Trofa | 369 |
| Maia | 353 |
| Santiago do Cacém | 348 |
| Vila Franca do Campo | 344 |
| Vila Nova de Gaia | 343 |
| Idanha-a-Nova | 336 |
| Vila Real | 324 |
| Sardoal | 320 |
| Castro Verde | 316 |
| Portalegre | 315 |
| Proença-a-Nova | 315 |
| Santa Cruz | 311 |
| Portimão | 310 |
| Valpaços | 304 |
| Oleiros | 300 |
| Porto Moniz | 299 |
| Penamacor | 295 |
| Vila do Bispo | 291 |
| Évora | 279 |
| Manteigas | 266 |
| Ribeira Brava | 257 |
| Mortágua | 250 |
| Oliveira do Hospital | 244 |
| Paços de Ferreira | 229 |
| Lagoa - Açores | 217 |
| Marco de Canaveses | 182 |
| Torre de Moncorvo | 182 |
| Ponta Delgada | 164 |
| Ponta do Sol | 163 |
| Resende | 158 |
| Freixo de Espada à Cinta | 152 |
| Mesão Frio | 151 |
| Santana | 149 |
| Montalegre | 144 |
| Avis | 141 |
| Lajes das Flores | 137 |
| Vila Velha de Ródão | 127 |
| Machico | 125 |
| Funchal | 116 |
| Aljezur | 107 |
| Santa Cruz das Flores | 92 |
| Vila de Rei | 90 |
| Nordeste | 82 |
| Carrazeda de Ansiães | 71 |
| Sousel | 68 |
| Odemira | 65 |
| Praia da Vitória | 56 |
| Povoação | 50 |
| Horta | 48 |
| São Brás de Alportel | 48 |
| Calheta | 44 |
| Vila Pouca de Aguiar | 41 |
| Vila do Porto | 35 |
| Calheta - Açores | 26 |
| Corvo | 0 |
| Lajes do Pico | 0 |
| Santa Cruz da Graciosa | 0 |
| São Roque do Pico | 0 |
| São Vicente | 0 |
| Madalena | -17 |
| Vimioso | -25 |
| Crato | -32 |
| Velas | -39 |
| Angra do Heroísmo | -68 |
| Monchique | -79 |
| Marvão | -167 |
| Gavião | -184 |
| Castanheira de Pêra | -230 |
| Macedo de Cavaleiros | -310 |
| Tabuaço | -431 |
| Vidigueira | -1016 |
| Mora | -1329 |
| Mourão | -2572 |